चौधरी प्रयोगशाला में किए गए शोध ने बैक्टीरिया में प्रोटीन-आधारित चयापचय अंगिकाओं (माइक्रोकंपार्टमेंट्स या MCPs) का आणविक विश्लेषण प्रस्तुत किया, जो विभिन्न चयापचय प्रक्रियाओं के अनुकूलन में शामिल होते हैं। हमारी प्रयोगशाला MCPs के भीतर चयापचय प्रक्रियाओं को समझने और उनके चिकित्सीय लक्ष्य विकसित करने की संभावनाओं की खोज में लगी हुई है।बैक्टीरियल MCPs विभिन्न जैव प्रौद्योगिकी अनुप्रयोगों में एन्कैप्सुलेटिंग प्लेटफॉर्म के रूप में आणविक कक्षों के रूप में बड़ी संभावनाएँ रखते हैं। हमारी टीम माइक्रोकंपार्टमेंट तकनीक पर आधारित सिंथेटिक नैनोरिएक्टर डिजाइन करने में लगी हुई है, ताकि बायोरिन्यूएबल्स, API आदि के उच्च स्तर के उत्पादन को सक्षम बनाया जा सके।