बायोऑर्गेनिक रसायन विज्ञान एक अत्यधिक अंतर्विषयक क्षेत्र है जो जैविक प्रक्रियाओं का अध्ययन करने के लिए कार्बनिक रसायन विज्ञान की अवधारणाओं और उपकरणों का उपयोग करता है, जिनमें पेप्टाइड्स, प्रोटीन, न्यूक्लिक एसिड्स, प्राकृतिक उत्पाद, कार्बोहाइड्रेट्स, लिपिड्स आदि जैसे बायोमोलेक्यूल शामिल हैं। बायोऑर्गेनिक रसायन विज्ञान कार्बनिक रसायन विज्ञान और बायोकेमिस्ट्री के बीच की खाई को पाटता है। यह क्षेत्र नवीन रासायनिक प्रक्रियाओं के विकास के लिए जैविक घटकों और प्रणालियों के उपयोग का भी अन्वेषण करता है। CSIR-NCL में बायोऑर्गेनिक रसायन विज्ञान/रासायनिक जीवविज्ञान की शुरुआत 1980 के शुरुआत में हुई थी। तब से, कई शोध समूह पेप्टाइड्स, न्यूक्लिक एसिड्स, प्राकृतिक उत्पाद, कार्बोहाइड्रेट्स, बायोकैटलिसिस, बायोसिंथेसिस आदि के क्षेत्र में सक्रिय रूप से काम कर रहे हैं।