TRIPS
Tandem Repeats In Protein sequences
Tandem Single Amino Acids Repeats
|
|
Number of proteins containing the repeats |
|||||||||||||
|
|
Repeat length >=5 |
Repeat length >=10 |
Repeat length >=15 |
Repeat length >=20 allowing 10% mismatch |
||||||||||
|
Hydrophobic |
||||||||||||||
|
Poly-Glycine (G) |
679 |
|||||||||||||
|
Poly-Alanine (A) |
1078 |
|||||||||||||
|
Poly-Valine (V) |
0 |
0 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Leucine (L) |
1019 |
2 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Isoleucine (I) |
0 |
0 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Cysteine (C) |
1 |
0 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Methionine (M) |
0 |
0 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Tyrosine (Y) |
1 |
0 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Phenylalanine (F) |
2 |
0 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Tryptophane (W) |
0 |
0 |
0 |
0 |
||||||||||
|
Poly-Proline (P) |
630 |
|||||||||||||
|
Hydrophilic - polar uncharged |
||||||||||||||
|
Poly-Serine (S) |
977 |
|||||||||||||
|
Poly-Threonine(T) |
270 |
3 |
||||||||||||
|
Poly-Asparagine (N) |
257 |
|||||||||||||
|
Poly-Glutamine (Q) |
622 |
|||||||||||||
|
Hydrophilic -polar acidic |
||||||||||||||
|
Poly-Aspartic Acid (D) |
341 |
|||||||||||||
|
Poly-Glutamic Acid (E) |
804 |
|||||||||||||
|
Hydrophilic -polar basic |
||||||||||||||
|
Poly-Lysine (K) |
289 |
0 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Arginine (R) |
326 |
0 |
0 |
|||||||||||
|
Poly-Histidine (H) |
171 |
0 |
0 |
|||||||||||